Fra september 2015 understøtter Thimble projekter med flere filer. Du kan tilføje HTML-, CSS- og JavaScript-filer til dit projekts filtræ, som du kan tilgå i venstre side af Thimble-siden.
Understøttelse af flere filer giver dig mulighed for at oprette mere virkelighedstro projekter, der spænder over flere filer og mapper, og nemt inkludere anden open source-kode i dit projekt. Du kan også tilføje billedfiler fra dit skrivebord direkte til dit projekt. Tidligere tillod Thimble kun at tilføje web-baserede billeder.